Drosophila simulans ribosomal DNA transcriptional repeat unit Ð complete sequence
length 8087 bp
tandem repeat_unit 1..8087 ribosomal DNA
spacer 1..868 = external transcribed spacer (ETS)
rRNA 869..2863 = small subunit ribosomal RNA (18S ribosomal RNA)
spacer 2864..3552 = internal transcribed spacer 1 (ITS1)
rRNA 3553..3675 = 5.8S ribosomal RNA
spacer 3676..3703 = internal transcribed spacer 2a (ITS2a)
rRNA 3704..3733 = 2S ribosomal RNA
spacer 3734..4118 = internal transcribed spacer 2 (ITS2)
rRNA 4119..8087 = large subunit ribosomal RNA (28S ribosomal RNA)
TATAGGTAGGCAGTGGTTGCCGACCTCCCGCATTATTCGAAATATTTATTTCGGATTATGTTTATATTGGTTACATACAATAAAGTATATTATTATCCGTACAAATTTGTTTCTCAGTTC
TATAGAACACGGGACTTGGCTCCGCGGATAATAGGAATATACGCTTTTTAGATAATATCGTTGAAACAAAAGTCAAGTTTCTATTATATATAGAATAACAAATCGTTTCCATATATTATC
GTTAATTTTTGGAGGCAGGCAAATATTTATTTATTACCTGCCGTATAGTTGGATTATTATATCGTTACGGTATAATACAAATATGGATTCTTATGAAAGAAATATAAAATTATATATTAA
ATGTGGAAATATTATCATATGCGCTTGGTTTTATGTTATATATTACCAGAGAGATATATGAAAAGAGATAAATTTTAAATTTATCTTCAAAATGCAAATGATTTAACTTAATATTTATAT
TGGTTAAACAAAAATTGTACATGTGTGGATACAATAATTATGTATGTTGGAAATAAAATGATATTTTATAATGAAATATGTATATATAAAAAGATATAATTATAGAAACATATATATTAC
AATAATTATATGAAATTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTATAAATTAAAAATGAAATTATGGATTACGAATGCTATATAAAAATGGCCGTAATCGAATGGATATTTTACTTATAAATAT
ATATTTAAAATTTTACCCAAAGGCGAAATATTGAATTTTATTCAATATAATAAAAATCATGGAATTATATAAAGTGAAAAATCCATATATCTATTATATTGCTTATTTCGATTCAAAAAA
TATGAATGGAATATGAAGGAAAAACATTATTCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTTATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACACACGAATTAAAAGTGAAACCGCAAA
AGGCTCATTATATCAGTTATGGTTCCTTAGATCGTTAACAGTTACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCAATTAAAACATGAACCTTATGGGACATGTGCTTTTATTA
GGCTAAAACCAAGCGATCGCAAGATCGTTATATTGGTTGAACTCTAGATAACATGCAGATCGTATGGTCTTGTACCGACGACAGATCTTTCAAATGTCTGCCCTATCAACTTTTGATGGT
AGTATCTAGGACTACCATGGTTGCAACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCACT
CCCAGCTCGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACAGGACTCATATCCGAGGCCCTGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACAAGGACCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTG
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGGTTAAAACGTTCGTAGTTGAACTTGTGCTTCATACGGGTAGTACAACTTACAATTGTGGTTAGTACTAT
ACCTTTATGTATGTAAGCGTATTACCGGTGGAGTTCTTATATGTGATTAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCACTAGTGCTCTTAAACGAGTGTTATTG
TGGGCCGGTACTATTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTTCAAATGCCTGAATATTCTGTGCATGGGATAATGAAATAAGACCTCTGTTCTGCTTTCATTGGTTTTCAGAT
CAAGAGGTAATGATTAATAGAAGCAGTTTGGGGGCATTAGTATTACGACGCGAGAGGTGAAATTCTTGGACCGTCGTAAGACTAACTTAAGCGAAAGCATTTGCCAAAGATGTTTTCATT
AATCAAGAACGAAAGTTAGAGGTTCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCATAAACGATGCCAGCTAGCAATTGGGTGTAGCTACTTTTATGGCTCTCTCAGTCGCTTCCCGG
GAAACCAAAGCTTTTGGGCTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAA
CTTACCAGGTCCGAACATAAGTGTGTAAGACAGATTGATAGCTCTTTCTCGAATCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTCGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACG
AACGAGACTCAAATATATTAAATAGATATCTTCAGGATTATGGTGCTGAAGCTTATGTAGCCTTCATTCATGGTGGCAGTAAAATGTTTATTGTGTTTGAATGTGTTTATGTAAGTGGAG
CCGTACCTGTTGGTTTGTCCCATTATAAGGACACTAGCTTCTTAAATGGACAAATTGCGTCTAGCAATAATGAGATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCTGC
ACGCGCGCTACAATGAAAGTATCAACGTGTATTTCCTAGACCGAGAGGTCCGGGTAAACCGCTGAACCACTTTCATGCTTGGGATTGTGAACTGAAACTGTTCACATGAACTTGGAATTC
CCAGTAAGTGTGAGTCATTAACTCGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATTATTTAGTGAGGTCTCCGGACGTGATCACTGTGACGCCT
TGCGTGTTACGGTTGTTTCGCAAAAGTTGACCGAACTTGATTATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTATTGTATAATATCCTTAC
CGTTAATAAACATTTGTTATAATACAAATAAATACAATTTACCAAAATAAAAATATTACAAAATGATTCTACGGAATCAAAAGTTAAAGTGAAAATAAAATGTAGATGGCTTTTATTTTA
TTTATATGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGACTTTAACATTATTAATGTTGTTGTGCGTATTTGTGGCAGTACTTACTACAACAACGGCGTTTCCTATAAAAACAAATTCTCGAAAA
TGGAAATCGAAGAAACTAAACTAAATTCGAAAGTGGAAGTCGAATTAAAATTAAAATAATTTTGAATGTGGTAATCGAAATAAGTTTGTGTGTATATGGACCATAATATACACGCGTTGC
GAATATGTATTGTTCATCTATGTTATGAGCATACGTTGGCTAATGCAACAACCTAAAATATACAATGTTTGTACCTGTCATCCATCAGGTTAATGTTTTATATAAATTTTGCAGTATGTG
TCACCCAAAATAGCAAACCATAACCAGATTATTATGATACATAATGCTTATATGAAACTAAGACATTTCGCAACATTTATTTTAGGTATAAAAATAAATTTATTGAAGGAATTGATATAT
GCCAGTAAAATGGTGTATTTTTAATTTCTTTCAATAAAAACAATATTGACATTATATAAAAATGAATTATAAAACTCTAAGCGGTGGATCACTCGGCTCATGGGTCGATGAAGAACGCAG
CAAACTGTGCGTCATCGTGTGAACTGCAGGACACATGAACATCGACATTTTGAACGCATATCGCAGTCCATGCTGTTATGTACTTTAATTAATTTTATAGTGCTGCTTGGACTACATATG
GTTGAGGGTTGTAAGACTATGCTAATTAAGTTGTTTATAAATTTTTTATAAGCATATGGTATATTATTGGATTAAATAATGATTTTATTCATAATATTAAAAAAGAAATGAAAAACATTA
TCTCACATTTGAATGTGAAAAACGAAGAGAAATATTTTCTTTTTCAATCAAATAATACTGAGAAATGTCTAGCATAAAAAATTGAAATATTTTTCATCTAGAATTGTCTCTTATTAATGA
TTCGAAAAAAAAAAAACTTGGTTATGTTATTATTCTTCGTTGGTTCGTTAAATGGATAAAAAATAACTTTGCTTACAAGAACTATTGGAACTATTTATAACGAATTTAATTGATTGTTTT
ATCATTTATATATAAAGAATTTATGGCAAAATATAGTTATATATACAACCTCAACTCATATGGGACTACCCCCTGAATTTAAGCATATTAATTAGGGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGAT
TTTCTTAGTAGCGGCGAGCGAAAAGAAAACAGTTCAGCACTAAGTCACTTTGTCTATATGGCAAATGTGAGATGCAGTGTATGGAGCGTCAATATTCTAGTATGAGAAATTAATGATTTA
AGTCCTTCTTAAATGAGGCCATTTACCCATAGAGGGTGCCAGGCCCGTATAACGTTAATGATTACTAGATGATGTTTCCAAAGAGTCGTGTTGCTTGATAGTGCAGCACTAAGTGGGTGG
TAAACTCCATCTAAAACTAAATATAACCATGAGACCGATAGTAAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTCTGAATAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAACTGCTTAGAGGTTAA
GCCCGATGAACCTGAATATCCGTTATGGAAAATTCATCATTAAAATTGTAATATTTAAATAATATTATTAAGAATAATGTGCATTTTTTCCATATAAGGACATTGTAATCTATTAGCATA
TCCCAAATTTATCATAAAATATAACTTATAGTTTATTCCAATTAAATTGCTTGCATTTTAACACAGAATAAATGTTATTAATTTGATAAAGTGCTGATAGATTTATATTATTACAGAGCG
TTAATTTTTCGGAATTATATAATGGCATAATTATCATTGATTTTTGTGTTTATTATATGCTCTTGTATGATTAACAATGCGAAAGATTCAGGATACCTTCGGGACCCGTCTTGAAACACG
GACCAAGGAGTCTAACATATGTGCAAGTTATTGGGATGTAAACCTAATAGCGTAATTAACTTGACTAATAATGGGATTAGTTTTTTAGCTATTTATAGCTAATTAACACAATCCCGGGGC
GTTCTATATAGTTATGTATAATGTATATTTATATTATTTATGCCTCTAACTGGAACGTACCTTGAGCATATATGCTGTGACCCGAAAGATGGTGAACTATACTTGATCAGGTTGAAGTCA
GGGGAAACCCTGATGGAAGACCGAAACAGTTCTGACGTGCAAATCGATTGTCAGAATTGAGTATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTTCCGAAGTTTCCCTC
AGGATAGCTGGTGCATTTTAATATTATATAAAATAATCTTATCTGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTAGGGTCGAAACGATCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATGGGTAAGAACCT
TAACTTTCTTGATATGAAGTTCAAGGTTATGATATAATGTGCCCAGTGGGCCACTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGCTGTGGGATGAACCAAACGTAATGTTACGGTGCCCAAATTAACAA
CTCATGCAGATACCATGAAAGGCGTTGGTTGCTTAAAACAGCAGGACGGTGATCATGGAAGTCGAAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCTGCCGAAGCAACTAGCCCTTAAAAT
GGATGGCGCTTAAGTTGTATACCTATACATTACCGCTAAAGTAGATGATTTATATTACTTGTGATATAAATTTTGAAACTTTAGTGAGTAGGAAGGTACAATGGTATGCGTAGAAGTGTT
TGGCGTAAGCCTGCATGGAGCTGCCATTGGTACAGATCTTGGTGGTAGTAGCAAATAATCGAATGAGACCTTGGAGGACTGAAGTGGAGAAGGGTTTCGTGTGAACAGTGGTTGATCACG
AGTTAGTCGGTCCTAAGTTCAAGGCGAAAGCCGAAAATTTTCAAGTAAAACAAAAATGCCTAACTATATAAACAAAGCGAATATAATACACTTGAATAATTTTGAACGAAAGGGAATACG
GTTCCAATTCCGTAACCTGTTGAGTATCCGTTTGTTATTAAATATGGGCCTCGTGCTCATCCTGGCAACAGGAACGACCATAAAGAAGCCGTCGAGAGATATCGGAAGAGTTTTCTTTTC
TGTTTTATAGCCGTACTACCATGGAAGTCTTTCGCAGAGAGATATGGTAGATGGGCTAGAAGAGCATGACATATACTGTTGTGTCGATATTTTCTCCTCGGACCTTGAAAATTTATGGTG
GGGACACGCAAACTTCTCAACAGGCCGTACCAATATCCGCAGCTGGTCTCCAAGGTGAAGAGTCTCTAGTCGATAGAATAATGTAGGTAAGGGAAGTCGGCAAATTAGATCCGTAACTTC
GGGATAAGGATTGGCTCTGAAGATTGAGATAGTCGGGCTTGATTGGGAAACAATAACATGGTTTATGTGCTCGTTCTGGGTAAATAGAGTTTCTAGCATTTATGTTAGTTACTTGTTCCC
CGGATAGTTTAGTTACGTAGCCAATTGTGGAACTTTCTTGCTAAAATTTTTAAGAATACTATTTGGGTTAAACCAATTAGTTCTTATCAATTATAACGATTATCAATTAACAATCAATTC
AGAACTGGCACGGACTTGGGGAATCCGACTGTCTAATTAAAACAAAGCATTGTGATGGCCCTAGCGGGTGTTGACACAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAA
TTCAAGTAAGCGCGGGTCAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCT
ACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGAATAATTAGCGGGGAAAGAAGACCCTTTTGAGCTTGACTCTAATCTGGCAGTGTAAGGAGACATAAGAGGTGTAGAATAAGT
GGGAGATATTAGACCTCGGTTTGGTATCGTCAATGAAATACCACTACTCTTATTGTTTCCTTACTTACTTGATTAAATGGAACGTGTATCATTTCCTAGCCATTATACGGATATATTTAT
TATATCTTATGGTATTGGGTTTTGATGCAAGCTTCTTGATCAAAGTATCACGAGTTTGTTATATAATCGCAAACAAATTCTTTAATAAAACGATGCATTTATGTATTTTTGATTTGAAAA
TTTGGTATAACTCCAATTACTCAGGTATGATCCAATTCAAGGACATTGCCAGGTAGGGAGTTTGACTGGGGCGGTACATCTCTCAAATAATAACGGAGGTGTCCCAAGGCCAGCTCAGTG
CGGACAGAAACCACACATAGAGCAAAAGGGCAAATGCTGACTTGATCTCGGTGTTCAGTACACACAGGGACAGCAAAAGCTCGGCCTATCGATCCTTTTGGTTTAAAGAGTTTTTAACAA
GAGGTGTCAGAAAAGTTACCATAGGGATAACTGGCTTGTGGCGGCCAAGCGTTCATAGCGACGTCGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAAAATTCACCA
AGCGTTGGATTGTTCACCCATGCAAGGGAACGTGAGCTGGGTTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTAATGACAAAACGTTGTTGCGACAGCATTCCTGCGTAGTACGA
GAGGAACCGCAGGTACGGACCAATGGCACAATACTTGTTCGAGCGAACAGTGGTATGACGCTACGTCCGTTGGATTATGCCTGAACGCCTCTAAGGTCGTATCCGTGCTGGACTGCAATG
ATAAATAAGGGGCAATTTGCATTGTATGGCTTCTAAACCATTTAAAGTTTATAATTTATTTTATAAACGACAATGGATGTGATGCCAATGTAATTTGTAACATAGTAAATTAGGAGGATC
TTCGATCACCTGATGCCGCGCTAGTTACATATAAAAGCATTATTTAATACAATGACAAAGCCTAGAATCAATTGTAAACGACTTTTGTAACAGGCAAGGTGTTGTAAGTGGTTGAGCAGC
TGCCATACTGCGATCCACTGAAGCTTATCCTTTGCTTGATGATTCGA